土木工程學科主要依托于水工结构工程二级学科起步，水工结构工程二级学科2002年获硕士授予权，2018年获博士授予权，土木工程一级学科硕士点由2005年获批的结构工程和市政工程两个二级学科生长而来，于2018年获批一级学科硕士授予权。

學科現有教師21人，其中博士學位11人，碩士生導師9人。作爲焦点骨幹成員組建內蒙古自治區水資源保護與利用重點實驗室、黃河流域內蒙古段水資源與水環境綜合治理自治區協同創新中心、高效節水技術裝備與水土環境效應內蒙古自治區工程研究中心；擁有內蒙古科技重大專項烏海湖試驗站、河套灌區楊家河灌域水工建築物耐久性及水土環境力學試驗站等2個野外試驗基地。

学科面向自治区经济社会生长，结合地域土木工程和水利工程特点,依据地域特有的自然资源优势展开科學研究，逐步形成有地域特色、反映地域特点的研究结果。恒久开展寒区工程结构新体系、寒旱区岩土设计理论与防灾科学技术、高情况适应性绿色修建质料、寒区污水资源化与水情况修复技术等方面的研究。依托内蒙古自治区水资源掩护与利用重点实验室和与内蒙古农业大学土木工程综合实验室等科研平台，紧密围绕国家及自治区社会经济生长战略需求，形成服务地方经济建设、多学科融会理论研究、技术研发与社會服務于一体的学科特色。

近5年，主持在研或完成省部級以上科研項目16項，經費1200余元，其中：國家重點研發計劃課題1項、國家自然科學基金項目8項、自治區重大科技專項課題2項。發表論文120余篇，其中SCI、EI收錄高水平論文50余篇。授權發明專利21項，出书專著5部、教材2部。獲科技獎勵2項。